最佳解释推理（Inference to the Best Explanation，IBE）是利普顿（Peter Lipton，1954-2007）在1991年的一部同名的著作中提出来的。
所谓最佳解释推理，就是对于比较充分的观察证据O，有各种现实的和可能的解释H 1 ，H 2 ，……其中最好的解释及其所包含的理论实体是最真实的，反映了客观的真理。
例如，亚佛加德罗的分子假说，认为所有同体积气体，在相同的条件（如温度、压力）下分子数目是相同的，即一摩尔单位体积的克分子数为6.02×1023。我们通过布朗运动的分子动力学计算，通过 α 粒子衰变的氦核的计算，通过x光的衍射图像（它指明原子点阵晶格中原子的间距）进行的计算，通过密立根的最小电荷对金属电解质所包含的分子数的计算，还有通过黑体辐射中用普朗克常数来计算原子分子数等等计算，这些彼此独立的观察与测量都计算出一摩尔的克分子数是相同的。因此，分子理论和它指明的理论的实体及其数量是对这些相当充分的观察现象给出的一个最好的解释，于是我们就能理性地推出分子这微粒是真实存在的，我们获得了关于物体是由分子组成的真理。
如果原子-分子学说不是真理，只是范弗拉森所说的经验适当性，那么诸多不同种类的实验与测量会如此巧合地收敛到亚佛加德罗的克分子说，就简直是奇迹了。不承认科学中的经验的、预言的和工具意义的结果到处都只是巧合的奇迹，而认为它有接近真理、接近真实的东西的特征，这种论证就叫作无奇迹的论证（No-Miracles Argument，NMA），它是科学哲学家普特南最先提出来的。
普特南说：“对于实在论的正面论证就是，这是唯一的一种哲学，它使科学的成功不变成奇迹。” 科学中有许许多多这样的实例说明，科学的不可观察的理论实体及其行为规律与结构，是最佳解释的推理和无奇迹论证的结果。这里最佳解释的推理是一阶命题，而无奇迹论证是二阶命题，即关于最佳解释推理何以能导出实在论。例如，物种的进化用自然选择来进行解释，这个解释是最佳的解释，自然选择是真实的就是这个最佳解释的推理。又如恒星的红移，最佳的解释是恒星离我们退行而去，这个最佳解释推论出红移与恒星离我们退行是真实的；用这个解释连同其他证据我们还可以最佳解释宇宙膨胀和宇宙大爆炸的真实性。
当然严格说来，这个最佳解释的推理应该这样来表述：
（1）有足够充分的证据O；
（2）我们足够充分地考察了所有现实的和可能的假说H 1 ，H 2 ，…，H n ；
（3）我们选择了最有理解力、最有解释力、最能说明事情的机制、最受证据支持、最为符合观察现象的、最简单和最能与其他公认的原理相统一的最佳的解释H i ，最能符合我们在第二章中所说的科学合理性的标准，则我们得出结论H i 及其不可观察的实体是真实的，具有真理性。
我们还必须注意：这个从前提到结论的推理不是演绎推理，而是某种形式的归纳推理或皮尔士所提出的、现在为科学哲学家和逻辑学家所广泛研究的溯因推理（abduction）。
这里所说的最佳解释的推理是指我们有足够的信念来说明它是真理的或接受它为真理，不是说我们已经证明了最佳解释就是完全的真理。
所以，对于一个理论具有实在性这样的本体论承诺和认识论状况的最稳妥的表述应该是：凡是经受得住最佳解释推理考验的理论，依据无奇迹论证的原则就具有逼近真理的性质。我们在下面遇到的还是这个问题，不过是将这个问题更加具体化了。
